हम्बोल्ट पेंगुइन साल में एक बार अपने सारे पंख बदल लेते हैं। नॉर्वे में यह प्रक्रिया गर्मियों के अंत/शरद ऋतु की शुरुआत में, लगभग अगस्त और सितंबर के आसपास होती है।
शुरुआत में पेंगुइन के शरीर का अगला हिस्सा सफेद होता है और पेट पर काले धब्बे होते हैं, जबकि उनकी पीठ पूरी तरह से काली होती है। यह जंगली जीवों में छलावरण का एक बहुत ही आम तरीका है, जहाँ कई जानवरों का पेट उनकी पीठ की तुलना में हल्का होता है। गर्मियों के आते-आते, पेंगुइन की पीठ के पंख अस्थायी रूप से धीरे-धीरे भूरे रंग के होने लगते हैं, और यह इस बात का पक्का संकेत है कि वे अपने पंख बदलने की तैयारी कर रहे हैं। जब वे तैयार हो जाते हैं, तो पुराने पंख उनके शरीर से अलग दिखने लगते हैं, जिससे वे काफी "फूला हुआ" सा दिखने लगता है, और धीरे-धीरे वे झड़ जाते हैं। इस दौरान, पेंगुइन पानी में कम समय बिताते हैं और उनकी भूख कम हो जाती है, लेकिन सौभाग्य से यह केवल कुछ हफ्तों तक ही रहता है, और वे जल्दी ही अपने नए पंख उगा लेते हैं।
पेंगुइन के बच्चे भी अपनी त्वचा बदलते हैं। एक बार जन्म के तुरंत बाद और दूसरी बार लगभग एक वर्ष की आयु में। उस समय, वे चूजे की त्वचा से वयस्क त्वचा में परिवर्तित हो जाते हैं, और उनकी छाती पर एक विशिष्ट गहरी धारी आ जाती है और उनके चेहरे का रंग भी गहरा हो जाता है।